1.中央补助地方公共卫生专项资金地方病防治项目：为了加强大骨节病防治工作，中央财政安排专项资金，用于开展大骨节病，尤其是西部地区大骨节病防治工作。对甘肃、陕西、四川、青海和西藏自治区等全国大骨节病活跃病区进行病情调查，目的是正确掌握西部大骨节病活跃病区病情，进一步完善大骨节病病情监测体系和监测网络，同时对2万人次大骨节病高危人群进行预防性服硒工作。
　　大骨节病防治研究所负责项目技术方案的制定，承担技术指导、咨询、质量控制及汇总。
　　目前，全部项目省份已完成工作，2006年度项目总结报告已经完成。
　　2. 国家“十一五”科技支撑项目：配合四川省阿坝州扶贫开发综合防治大骨节病总体规划，大骨节病防治研究所承担国家“十一五”科技支撑计划“大骨节病综合防治研究”之子课题“大骨节病综合预防措施的研究”，课题研究经费预计300万元，目前，项目启动会、研究现场选点、现场基线资料采集及综合预防措施方案制定等前期工作已经完成。
　　3. 常规工作：深化真菌毒素与人类疾病的主攻方向，探索可能致病的真菌毒素及其致病机制，为制定防治策略和措施提供依据。主要内容：其一是真菌毒素宏观分布规律及本底值研究；二是真菌毒素的检测技术研究及环境中真菌毒素的监测；其三是真菌毒素致病机制和研究。具体是：
　　（1）大骨节病发病机制研究：经40年的艰苦探索，已证明大骨节病病因物质是粮食中的T－2毒素，当前和今后一段时间内是要进一步揭示T－2毒素致大骨节病的机制，为防治T－2毒素中毒提供技术支持。
　　（2）黄绿青霉毒素（CIT）致克山病的研究：根据病因流行病学、CIT致心肌损伤、线粒体损伤、DNA损伤等方面的研究资料，形成了根据充分的CIT致克山病的病因假设，将进一步验证该病因假设，完成慢性实验病理模型的研制，进行CIT致克山病、心肌病发病机制及心肌线粒体和DNA损伤的研究。
　　（3）粮食中真菌毒素检测方法的研究：真菌毒素存在于粮食中，因干扰物质多而且量大，分离提取十分困难，检查难度很大，是国际性难题。目前最灵敏、特异的检测方法是ELISA法。争取制备若干毒素的单克隆抗体，建立、发展真菌毒素的检测方法，打破制约真菌毒素与人类健康研究的障碍。同时发展GC/MS和HPLC等化学检测法。
　　（4）其它真菌毒素的研究：我们曾发现并证实了玉米赤霉烯酮（ZEN）致地方性乳腺肿大症，发现甘薯霉变与四川跁病病因关系密切，将继续此方面研究，进一步阐明机制，找出防治办法。另有DON、MON、DAS、赭曲霉毒素等真菌毒素的宏观分布规律和本底值研究等内容。
　　（5）老年病的研究：用病因流行病学方法研究骨关节炎、骨质疏松、心脑血管疾病、肿瘤等老年性疾病的分布及其危险因素，特别是与真菌毒素的关联，探讨其发病机制和防治办法。