哈尔滨医科大学由原哈尔滨医科大学（其前身为1926年伍连德博士建立的哈尔滨医学专门学校）和原兴山中国医科大学第一、二分校（其前身为1931年在江西瑞金建立的中国工农红军卫生学校）合并组建而成，具有悠久历史和光荣传统。学校传承伍连德博士“赤诚爱国、自强创业”的精神，发扬中国工农红军卫校“政治坚定、技术优良”的校风，经过79年创建和发展，成为具有相当规模和鲜明特色的医学院校，是黑龙江省重点建设的“211工程”院校。

    国家理科基础科学研究与教学人才培养基地、中国疾病预防控制中心地方病控制中心、国家新药临床试验研究中心、卫生部俄语培训中心、中国医学科学院黑龙江分院、黑龙江省医学科学院等设在我校。