我校于1986年7月18日根据文件“黑教委劳字[1986]294号文”正式设立“哈尔滨医科大学外事处”；2002年4月更名为“哈尔滨医科大学国际交流处”。在附属各学院设立主管国际交流事务的部门及专办员，与各学院的院长办公室合并办公。

 经过长时间、多方面的协调工作，我校与北美、西欧、日本、俄罗斯、澳大利亚、韩国、东南亚等国家及地区的五十一所大专院校或科研院所建立了友好关系。并与澳大利亚的拉筹伯大学、维多利亚工业大学、英国的米德塞斯大学和利兹大学以及俄罗斯符拉迪沃斯托克国立医科大学开展了联合办学的项目。其中，与拉筹伯大学联办的“社会医学与卫生事业管理学”硕士研究生班已经有三期学生完成学业并获得我校与澳方共同颁发的证书。

另一方面，为了提高师资层次，近年来我校每年聘任约二十名境外著名专家作为我校的名誉教授或客座教授为我们的医、教、研服务。同时，目前我校已聘任了十三位知名的海外华人专家作为博士研究生指导教师。仅2004年我校就接待400多名国外专家来访和讲学。

此外，我校与日本、俄罗斯的各友好院校之间还开展着长期、活跃的学生交流项目。每年，我校与俄罗斯符拉迪沃斯托克国立医科大学以及日本滋贺医科大学都互派学生以实习、研讨会等形式进行交流。

与此同时，通过校际间交流，我校每年至少派遣二十名教师赴日本、北美等发达国家或地区进行研修，并在医疗和科研方面取得了丰硕的成果。

国际交流处是学校执行国家外交政策和教育外事政策、处理全校外事工作的一个窗口部门，肩负着政策把关和外事管理的双重职责。

我们要以国际化大学为目标，继续坚持和扩大开放，加强国际间的交流与合作。通过引进国外智力、来华留学、出国留学、合作科研与合作办学等途径，弘扬中华文化、借鉴国际先进科学技术，扩大学校国际影响，培养具有国际视野的优秀人才，为学校现代化服务。