2017年，学校5所附属医院共有63名符合条件的在职住院医师申请参加学校住院医师规范化培训第二阶段考核，经过外语和专业理论考核，共有46人具有参加临床技能考核资格。12月16日和19日，在附属二院进行了临床技能考核；其中，在临床技能中心完成了22个专科、44人的考核，在临床科室完成了口腔内科和口腔修复科2个专科、2人的考核。外语和专业理论考核、临床技能考核均合格的，将获得住院医师规范化培训第二阶段培训合格证书。

学校自1996年在全省率先开展了全程5年的住院医师规范化培训，共分为两个阶段；培训合格者获得原卫生部授权颁发的《临床住院医师规范化培训合格证书》。2001年至2016年全校共有2455人获得了培训合格证书。

随着2014年国家住院医师规范化培训制度的正式建立，学校住院医师规范化培训第一阶段已全部纳入国家统一的3年住院医师规范化培训。为做好与住院医师规范化培训的密切衔接，逐步建立完善的毕业后医学教育体系，2017年，国家启动了专科医师规范化培训制度试点，经过遴选，我校附属一院和附属二院的神经外科、心血管病学、呼吸与危重症医学成为6个国家首批专科医师规范化培训制度试点基地。2017年12月，国家召开专科医师规范化培训制度试点招生工作会议，并定于2018年1月底前完成招生考试和录取工作。