哈尔滨医科大学微生物学教研室为黑龙江省重点学科、病原生物学博士授权点；是黑龙江省“感染与免疫”重点实验室、中俄医学研究中心“感染与免疫”研究所、黑龙江省普通高校医学病原学（BSL-3）重点实验室、人体自身免疫病诊疗技术国家地方联合工程研究中心的依托单位，建有病毒学与细菌学研究室。利用本教研室研究平台及哈医大转化医学中心平台开展科研、人才培养与转化医学工作。

教研室有一支素质高、实力强的教学科研师资队伍，是黑龙江省“感染与免疫”科技创新团队、黑龙江省优秀研究生导师团队。现有教师28人，有9位正教授，13位副教授，博士生导师7人，硕士生导师14人，国家“万人计划”教学名师1人，省级教学名师2人，省级特聘教授（龙江学者）2人，省优秀教师1人，省高校工委优秀共产党员2人，省杰出青年科学基金获得者2人，国务院学科评议组成员1人，省师德先进模范2人。

教研室坚持以学生为本，将培养全面发展的人才为己任，心系国家社会，树立新时代本着“全员-全程-全方位”的育人理念，以"团结、奉献"为宗旨，把本科教学和基础科学人才培养作为基本工作，重视教学改革。在课程整合、PBL教学以及培养创新型人才等方面进行了大量有意义工作。2014年教学改革“创新教学模式，培养基础医学拔尖人才”项目获得教育部国家级教学成果二等奖。同时，教研室承担的《医学微生物学》是教育部批准的国家精品资源共享课程、来华留学人员英文授课品牌课程、来华留学生临床医学专业本科教育（英语授课）MBBS精品在线开放课程、黑龙江省课程思政示范课程。教研室作为主编单位编写“十五”至“十三五”全国高等医学院校本科规划教材《医学微生物学》共4部，此外近五年还主编、副主编及参编教材及辅助教材19部。

科学研究上重视基础研究和转化医学研究。主要研究集中在3个稳定且有一定特色和优势的方向，包括①病原体来源非编码RNA的跨物种传播及其与宿主相互作用；②重要病原体感染的致病机制、耐药性与防治；③免疫相关疾病的发生机制、评价及防治。在“十三五”期间，获批科研经费1421万元，国家级科研项目16项，其中科技部重大专项3项、国家自然科学基金13项、省部级科研项目6项。发表SCI论文72篇，最高影响因子8.961，中文核心期刊80篇。获教育部自然科学二等奖1项，黑龙江省政府科学技术二等奖3项。授权专利7项。举办全国第十三届病毒学研讨会、中俄国际会议及“伍连德”论坛6次。

经过团队长期不懈努力，微生物学教研室在学术梯队、人才培养、科学研究、国际交流以及条件建设等方面形成了比较明显的优势与特色，现已成为集研究、教育与产业发展为一体的优势学科。