哈尔滨医科大学基础医学院，在发展初期，前身设置有解剖学系、组织胚胎学系、生理药理学系、病理学系、微生物学系、卫生学系、生物化学学系、俄文学系等八个学系。1954年经中华人民共和国卫生部批准成立基础医学部。1992年，基础医学部改建制成立哈尔滨医科大学基础医学学院。

学院现有一级学科博士点2个、二级学科博士点10个、二级学科硕士点11个；博士后流动站2个。学院现有国家引才引智示范基地1个，教育部重点实验室1个，国家地方联合工程研究中心1个，黑龙江省国际科技合作平台1个，黑龙江省重点实验室4个，教育厅重点实验室3个，研究所 3个。教育部一流本科“双万计划”专业（基础医学）1个，省级重点专业（基础医学）1个。教研室13个，实验教学中心4个，基础医学国家级实验教学示范中心及国家级虚拟仿真实验教学示范中心各1个。国家地方联合工程中心1个，中俄结核病联合研究中心1个，中俄感染与免疫研究所1个，伍连德研究所和黑龙江省基础医学研究所设在学院。

学院在岗教职工311人，教师251人，其中，教授90人，副教授106人；具有博士学位教师占89.6%，具有硕士学位教师占9.1%；45岁以下教师146人占58.17%。在岗博士生导师60名、硕士生导师97名。现有中国工程院院士1名，教育部长江学者特聘教授2名，国家杰出青年基金获得者1名，中组部国家高层次人才特殊支持计划领军人才2名。国家级教学名师2名，全国优秀教师1名，国务院政府特殊津贴专家4名，省级教学名师5名，省级优秀教师7名，省“三育人”先进个人2名，龙江学者特聘教授7名，国家卫计委中青年专家3名，省杰出青年基金获得者5名，省级优秀中青年专家3名，省卫生系统突出贡献专家5名。现有国家级优秀教学团队1个，国家级科技创新团队1个，省级优秀教学团队2个，省“双一流”建设学科1个，省级优秀研究生导师团队2个，省科技创新团队2个，省高等学校优秀科研创新团队3个，省领军人才梯队8个，哈尔滨医科大学跨学科团队2个。

学院领导

李   辉  党委书记

潘振伟  院长

刘振洪  伍连德书院院长兼党委副书记

朱骥伟  副院长

曹   博  副院长

杨慧科  副院长

孔庆飞  副院长