姓 名：靳喜云

职称职务：副研究员

博士生导师

硕士生导师

研究方向：生物医学信息处理与精准医学

E-mail：jinxiyun@hrbmu.edu.cn

靳喜云，哈尔滨医科大学医工交叉学院副研究员，博士/硕士导师。主要从事肿瘤免疫信息学与复杂疾病生物信息处理相关研究。主持国自然青年科学基金项目（C类）、2023年度国家资助博士后研究人员计划（C档）项目以及黑龙江博士后面上项目。主要研究成果发表于Nucleic Acids Research 、Briefings in Bioinformatics、Molecular Therapy-Nucleic Acids等期刊。

教育经历

2019.09 - 2023.09    哈尔滨工业大学     生物医学工程                 博士

2016.09 - 2019.07    哈尔滨医科大学    生物医学工程                 硕士

2011.09 - 2016.07    哈尔滨医科大学    生物技术（生物信息）    学士

工作经历

2025.09-至今              哈尔滨医科大学    医工交叉学院    副研究员

2024.09-2025.08        哈尔滨医科大学    医工交叉学院    讲师

2023.10-2026.05        哈尔滨医科大学    医工交叉学院    博士后

科研项目

1) 国家自然科学基金委员会，青年科学基金项目，基于单细胞多组学测序数据的个体化癌症药物组合筛选方法研究（32400542），2025.01-2027.12，30万元，在研，主持

2) 黑龙江省博士后面上项目，泛癌单细胞多组学联合的免疫治疗响应机制解析及治疗靶点优选方法研究（LBH-Z24023），2025.01-2026.12，20万元，在研，主持

3) 中国博士后科学基金会，2023年度国家资助博士后研究人员计划（C档），基于外周血免疫组大数据及人工智能的癌症早筛方法研究（GZC20230646），2024.01-2025.12, 24万元，在研，主持

4) 国家自然科学基金委员会，重大项目，肿瘤反应性T细胞受体的智能预测与生成（T2495273），2025.01-2029.12，519万元，在研，参与

5) 国家自然科学基金委员会，重点项目，基于单细胞多组学数据的癌症模式挖掘理论与方法研究（62032007），2021.01-2025.12，299万元，在研，参加

6) 国家自然科学基金委员会，面上项目，基因组结构变异衍生的癌症新抗原智能筛选方法研究（32470691），2025.01-2028.12，50万元，在研，参与

代表性论文

1) Xiyun Jin#, Wenyang Zhou#, Meng Luo#, Pingping Wang, Zhaochun Xu, Kexin Ma, Huimin Cao, Chang Xu, Yan Huang, Rui Cheng, Lixing Xiao, Xiaoyu Lin, Fenglan Pang, Yiqun Li, Huan Nie, Qinghua Jiang*. Global characterization of B cell receptor repertoire across COVID-19 patients by single-cell V(D)J sequencing. Briefings in Bioinformatics. 2021 May 20:bbab192. (SCI IF: 7.7)

2) Xiyun Jin#; Yideng Cai#; Guangfu Xue; Jinhao Que; Rui Cheng; Yuexin Yang; Lixing Xiao; Xiaoyu Lin; Chang Xu; Pingping Wang; Zhaochun Xu*; Huan Nie*; Qinghua Jiang*; Identification of shared characteristics in tumor-infiltrating T cells across 15 cancers, Molecular Therapy - Nucleic Acids, 2023, 32: 189-202(SCI IF: 6.1)

3) Shi, Jingyi#; Zhang, Shiqian#; Lu, Zhenglin#; Zhou, Weiwei#; Lu, Weijian; Chen, Gengdong; Li, Jianing; Liu, Wenhui; Huang, Jiaqi; Jiang, Tiantongfei; Jin, Xiyun*; Xu, Juan*; Shao, Tingting*. CellSNVReg: a multi-dimensional resource for SNV-mediated regulatory perturbations in single-cell and spatial omics. Nucleic Acids Research. 2025 Oct 31:gkaf1076(SCI IF: 13.1)

4) Dezhong Lv#; Donghao Li#; Yangyang Cai#; Jiyu Guo#; Sen Chu; Jiaxin Yu; Kefan Liu; Tiantongfei Jiang; Na Ding; Xiyun Jin*; Yongsheng Li*; Juan Xu*; CancerProteome: a resource to functionally decipher the proteome landscape in cancer, Nucleic Acids Research. 2024 Jan 5;52(D1). (SCI IF: 13.1)

5) Chang Xu#, Xiyun Jin#, Songren Wei, Pingping Wang, Meng Luo, Zhaochun Xu, Wenyi Yang, Yideng Cai, Lixing Xiao, Xiaoyu Lin, Hongxin Liu, Rui Cheng, Fenlan Pang, Rui chen, Xi Su, Guohua Wang, Ying Hu, Qinghua Jiang*. DeepST identifying spatial domains in spatial transcriptomics by deep learning. Nucleic Acids Research. 2022 50(22). (SCI IF: 13.1)

6) Yongsheng Li#, Xiyun Jin#, Zishan Wang, Lili Li, Hong Chen, Xiaoyu Lin, Song Yi*, Yunpeng Zhang* and Juan Xu*. Systematic review of computational methods for identifying miRNA-mediated RNA-RNA crosstalk. Briefings in Bioinformatics. 2019 Jul 19;20(4):1193-1204. (SCI IF: 7.7)

7) Mengying Zhang#, Xiyun Jin#, Junyi Li, Yi Tian, Qi Wang, Xinhui Li, Juan Xu*, Yongsheng Li* and Xia Li*. CeRNASeek: an R package for identification and analysis of ceRNA regulation. Briefings in Bioinformatics. 2021 May 20;22(3):bbaa048. (SCI IF: 7.7)

8) Dezhong Lv#, Kang Xu#, Xiyun Jin#, Junyi Li, Yuchen Shi, Mengying Zhang, Xiaoyan Jin, Yongsheng Li, Juan Xu*, Xia Li*. LncSpA: LncRNA Spatial Atlas of Expression across Normal and Cancer Tissues. Cancer Research. (2020) 80 (10): 2067–2071. (SCI IF: 16.6)

9) Pingping Wang#, Xiyun Jin#, Wenyang Zhou, Meng Luo, Zhaochun Xu, Chang Xu, Yiqun Li, Kexin Ma, Huimin Cao, Yan Huang, Guangfu Xue, Shuilin Jin, Huan Nie*, Qinghua Jiang*. Comprehensive analysis of TCR repertoire in COVID-19 using single cell sequencing. Genomics. 2021 Mar;113(2):456-462. (SCI IF: 3.0)

10）Kang Xu#, Xiyun Jin#, Ya Luo, Haozhe Zou, Dezhong Lv, Liping Wang, Limei Fu, Yangyang Cai, Tingting Shao, Yongsheng Li*, Juan Xu*. Spatial transcriptome analysis of long non-coding RNAs reveals tissue specificity and functional roles in cancer. Journal of Zhejiang University SCIENCE B. 2022 July, accepted. (SCI IF: 4.9)