新抗原介导的癌症免疫疗法（如T细胞疗法和疫苗）通过识别HLA呈递的抗原，激活CD8⁺细胞毒性T细胞以清除肿瘤。目前新表位多来源于癌症基因组中的非同义突变，但“冷”肿瘤突变少、表位稀缺，缺乏有效靶点。

2025年5月21日，我院李永生教授团队整合14大常见癌型和29个正常组织的免疫肽组数据、识别近46万条HLA呈递的表位，成功构建了肿瘤-正常表位图谱，为优选用于个性化癌症免疫治疗的新抗原提供了新的视角。该成果以研究型论文《Immunopeptidomics-guided discovery and characterization of neoantigens for personalized cancer immunotherapy》发表于Science子刊《Science Advances》。

该项研究主要实现了三大突破：

1.构建肿瘤-正常表位图谱：团队收集并重新分析了公开可用的免疫肽组学数据集，涵盖14种肿瘤和29种正常组织，在各类癌症和正常组织中检测到389,165条经典表位和70,270条非经典表位序列，并揭示非经典表位具有与经典表位相似的免疫特征。

2.开发新抗原优选算法：将肽段划分为肿瘤肽段与正常肽段，发现他们在多种理化性质上具有差异，例如：氨基酸组成、疏水性、净电荷等，反映出其特有的微环境和代谢特征。随后基于差异特征提出MaNeo，优先排序为免疫治疗候选靶点的新表位。

3.优选新抗原的功能验证：通过MaNeo筛选3个候选新表位，其负载的树突状细胞可以激活CD8⁺T细胞，促进其增殖和细胞因子分泌，特异性识别肿瘤细胞且无损伤正常细胞，验证了其免疫活性和抗肿瘤效果，证明MaNeo模型预测准确且具泛化能力。

该项研究通过构建肿瘤-正常表位图谱，揭示了肿瘤和正常组织中表位的高度异质性，开发了新抗原优选模型，为癌症免疫疗法潜在治疗靶点的识别提供了新的见解。

哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院2023级博士研究生蔡阳阳、药学院博士后宫熳钰、2023级硕士研究生曾梦倩和冷锋为本文的共同第一作者。哈尔滨医科大学医工交叉学院李永生教授、生物信息科学与技术学院徐娟教授、药学院张莹教授为本文的共同通讯作者。

原文链接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/40397742/

图文：李永生、蔡阳阳

编辑：杨梓仪

初审：谭仁杰

终审：蒋庆华