哈尔滨医科大学医工交叉学院院长、哈尔滨医科大学附属肿瘤医院双聘教授，国家杰出青年科学基金获得者、国家优秀青年科学基金获得者，主要从事智能医学研究，聚焦肿瘤智能早筛、肿瘤mRNA疫苗智能设计、人工智能药物设计等前沿方向，科技创新2030—“新一代人工智能”重大项目首席科学家、主持基金委杰青、优青、重点、面上等项目7项，基金委重大研究计划重点项目1项，以第一或通讯作者身份在Cell、Nature Communications、Genome Biology、Cancer Research、Oncogene、PNAS、NAR、Bioinformatics等期刊发表论文100余篇，获中国百篇最具影响国际学术论文2篇，获黑龙江省自然科学一等奖2项（分别为第一、第二完成人）、全球前2%顶尖科学家科学影响力榜单、爱思唯尔中国生物医学工程领域高被引学者。国家重点研发计划“生物与信息融合（BT与IT融合）”重点专项指南编制专家组专家、中国计算机学会生物信息学专委会常务委员、中国人工智能学会生物信息学与人工生命专委会常务委员、中国自动化学会智能健康与生物信息专业委员会委员、中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会肿瘤测序及大数据分析协作组常务委员，基金委杰青、优青、重大、重点、区域联合基金重点、专项项目以及面青地项目会议评审专家。

教育经历

2007.03——2010.06    哈尔滨工业大学    计算机应用技术           博士

2003.09——2006.07    吉林大学              计算数学及应用软件    硕士

1999.09——2003.07    吉林大学              信息与计算科学           学士

工作经历

2023.02–至今        哈尔滨医科大学  医工交叉学院             院长

2017.05–2021.04  哈尔滨工业大学  生物信息党支部          党支部书记

2017.11–2020.10  哈尔滨工业大学  生命科学与技术学院    院长助理

2015.12–2023.01  哈尔滨工业大学  生命科学与技术学院    教授（破格）

2013.12–2015.12  哈尔滨工业大学  生命科学与技术学院    副教授

2011.11–2012.11  哈佛大学            医学院                        访问学者

2010.08–2012.12  哈尔滨工业大学  生命科学与技术学院    讲师

科研项目

1）国家自然科学基金委员会，杰出青年科学基金，复杂疾病的组学大数据处理与挖掘（T2325009），2024.1-2028.12，400万，主持

2）科技创新2030—“新一代人工智能重大专项，重大项目，基于外周免疫特征的泛癌种智能早筛关键技术研发（2022ZD0117700），2023.3-2026.2，1500万，主持

3）科技部&雄安新区科技创新专项，基于多组学数据及人工智能的癌症mRNA 疫苗设计与构建（2022XAGGO117），2022.10-2025.9，2600万，主持

4）国家自然科学基金委员会，重大研究计划重点项目，基于外周血免疫组大数据的泛癌种智能早期诊断关键技术研究（92574205），2026.1-2029.12，300万，主持

5）国家自然科学基金委员会，重点项目，基于单细胞多组学数据的癌症模式挖掘理论与方法研究（62032007），2021.01-2025.12，299万，主持

6）国家自然科学基金委员会，优秀青年科学基金，复杂疾病的生物信息处理与分析（61822108），2019.1-2021.12，130万，主持

代表性论文

1）X Ren#, W Wen#, X Fan#, W Hou#, B Su#, P Cai#, J Li#, Y Liu#, F Tang#, F Zhang#, Y Yang#, J He#, W Ma#, J He#, P Wang#, Q Cao, F Chen, Y Che, X Cheng, G Deng, X Deng, W Ding, Y Feng, R Gan, C Guo, W Guo, S He, C Jiang, J Liang, Y Li, J Lin, Y Lin, H Li, J Liu, N Liu, S Liu, M Luo, Q Ma, Q Song, W Sun G Wang, F Wang, YWang, X Wen, Q Wu, G Xu, X Xie, X Xiong, X Xing, H Xu, C Yin, D Yu, K Yu, J Yun, B Zhang, P Zhang, T Zhang, J Zhao, P Zhao, J Zhou, W Zhou, S Zhong, X Zhong, S Zhang, L Zhu, P Zhu, B Zou, J Zou, Z Zuo, F Bai, X Huang, P Zhou*, Qinghua Jiang*, Z Huang*, J Bei*, L Wei*, X Bian*, X Liu*, T Cheng*, X Li,*, P Zhao*, F Wang*, H Wang*, B Su*, Z Zhang*, K Qu*, X Wang*, J Chen*, R Jin*, Z Zhang*. COVID-19 immune features revealed by a large-scale single cell transcriptome atlas. Cell. 2021 Apr 1;184(7):1895-1913. 

2）Jinhao Que#, Guangfu Xue#, Tao Wang#, Xiyun Jin, Zuxiang Wang, Yideng Cai, Wenyi Yang, Meng Luo, Qian Ding, Jinwei Zhang, Yilin Wang, Yuexin Yang, Fenglan Pang, Yi Hui, Zheng Wei, Jun Xiong, Shouping Xu, Yi Lin, Haoxiu Sun*, Pingping Wang*, Zhaochun Xu*, Qinghua Jiang*. Identifying T cell antigen at the atomic level with graph convolutional network. Nature Communications. 2025 Jun 4;16(1):5171.

3）Wenyi Yang#, Zhaochun Xu#, Pingping Wang, Meng Luo, Yideng Cai, Chang Xu, Guangfu Xue, Jinhao Que, Qian Ding, Xiyun Jin, Yuexin Yang, Fenglan Pang, Huan Nie, Yong Ji*, Qinghua Jiang*.Deciphering cell-cell communication at single-cell resolution for spatial transcriptomics with subgraph-based graph attention network. Nature Communications. 2024 Aug 18;15(1):7101.

4）Songren Wei#, Meng Luo#, Pingping Wang#, Rui Chen#, Xiyun Jin, Chang Xu, Chenyang Li, Xiaoyu Lin, Zhaochun Xu, Hongxin Liu, Rui Cheng, Wenyi Yang, Yideng Cai, Guangfu Xue, Peng Huang, Zhigang Liu, Haoxiu Sun*, Jiangping Xu*, Qinghua Jiang*. Charting the Spatial Transcriptome of the Human Cerebral Cortex at Single-Cell Resolution. Nature Communications. 2025 Aug 19;16(1):7702.

5）Qian Ding#, Wenyi Yang#, Guangfu Xue#, Hongxin Liu, Yideng Cai, Jinhao Que, Xiyun Jin, Meng Luo, Fenglan Pang, Yuexin Yang, Yi Lin, Yusong Liu, Haoxiu Sun, Renjie Tan, Pingping Wang*, Zhaochun Xu*, Qinghua Jiang*. Dimension reduction, cell clustering and cell-cell communication inference for single-cell transcriptomics with DcjComm. Genome Biology, 2024 Sep 9;25(1):241. 

6）Chang Xu#, Xiyun Jin#, Songren Wei#, Pingping Wang, Meng Luo, Zhaochun Xu, Wenyi Yang, Yideng Cai, Lixing Xiao, Xiaoyu Lin, Hongxin Liu, Rui Cheng, Fenglan Pang, Rui Chen, Xi Su, Ying Hu, Guohua Wang, Qinghua Jiang*. deepST: Identification of spatial domains in spatial transcriptomics by deep learning. Nucleic Acids Research. 2022 Dec 9;50(22):e131.

7）Rui Cheng#, Lixing Xiao#, Wenyang Zhou#, Xiyun Jin, Zhaochun Xu, Chang Xu, Pingping Wang, Meng Luo, Mengyun Wang, Kexin Ma, Huimin Cao, Yan Huang, Xiaoyu Lin, Fenglan Pang, Yiqun Li, Qinghua Jiang*. A pan-cancer analysis of alternative splicing of splicing factors in 6904 patients. Oncogene. 2021. doi: 10.1038/s41388-021-01947-7

8) Yideng Cai#, Meng Luo #, Wenyi Yang, Chang Xu, Pingping Wang, Guangfu Xue, Xiyun Jin, Rui Cheng, Jinhao Que, Wenyang Zhou, Yu Li, Qinghua Jiang*, Zhaochun Xu*.iCanTCR: a deep learning framework for early cancer detection using T cell receptor repertoire in peripheral blood. Cancer research. 2024 Jun 4;84(11):1915-1928.

9）Zhaochun Xu#, Meng Luo#, Weizhong Lin#, Guangfu Xue, Pingping Wang, Xiyun Jin, Chang Xu, Wenyang Zhou, Yideng Cai, Wenyi Yang, Huan Nie, Qinghua Jiang*. DLpTCR: an ensemble deep learning framework for predicting immunogenic peptide recognized by T cell receptor. Briefings in Bioinformatics. 2021 Nov 5;22(6):bbab335.

10） Fenglan Pang#, Guangfu Xue#, Wenyi Yang#, Yideng Cai, Jinhao Que, Haoxiu Sun, Pingping Wang, Shuaiyu Su, Xiyun Jin, Qian Ding, Zuxiang Wang, Meng Luo, Yuexin Yang, Yi Lin, Renjie Tan, Yusong Liu*, Zhaochun Xu*, Qinghua Jiang*. TriCLFF: a multi-modal feature fusion framework using contrastive learning for spatial domain identification. Briefings in Bioinformatics. 2025 Jul 2; 26(4):bbaf316.

获奖情况

1) 2021 黑龙江省自然科学一等奖（第一完成人：复杂疾病生物信息处理与分析）

2) 2019 黑龙江省自然科学一等奖（第二完成人：基因组大数据分析理论与方法）

3) 2023-2024 全球前2%顶尖科学家科学影响力榜单

4) 2020-2024 爱思唯尔中国高被引学者（生物医学工程领域）

5) 2020 获中国百篇最具影响国际学术论文（通讯作者）

6) 2010 获中国百篇最具影响国际学术论文（第一作者）