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郝大鹏团队建立评估单细胞对免疫治疗反应的评分工具scResponse
发布时间:2026-03-27 发布者: 浏览次数:

免疫检查点阻断在癌症治疗中已展现出巨大潜力,但许多患者未能获得长期疗效。目前,预测免疫治疗响应的工具主要在患者层面进行分析,而无法捕捉微环境中不同组分的独特贡献。单细胞测序技术是理解细胞多样性如何影响治疗结局的有力工具,但目前仍缺乏在单细胞分辨率下评估免疫治疗响应的可靠方法。

2026年3月23日,哈尔滨医科大学基础医学院郝大鹏教授团队的博士后董琪和博士生黄海军等在《Advanced Science》期刊发表题为《scResponse: A Rank-Based Method for Identifying Cell States That Contribute to Immunotherapy Response by Single-Cell Data的研究论文。该研究首次提出了一种能够量化单细胞对免疫治疗响应程度的算法scResponse,并建立便于研究人员使用的R包“scResponse”。该工具为发现肿瘤治疗新靶点和开发新型免疫治疗增敏策略提供了新的机制性见解。

scResponse能够捕捉不同细胞亚型或细胞状态对免疫治疗响应的细微影响,包括血管内皮细胞的血管正常化状态、巨噬细胞的极化状态、CD8+T细胞的耗竭亚型以及不同成纤维细胞亚型的相反作用等。通过将免疫治疗响应与单细胞状态相联系,scResponse能够描绘不同的生物学过程是如何塑造细胞状态,进而导致不同的免疫治疗结局。例如,上皮细胞在响应和非响应患者中表现显著响应评分(RScore)差异,其代谢变异可能是潜在的影响因素。通过整合泛癌单细胞转录组数据,团队利用scResponse确定了与肿瘤细胞响应状态相关的关键代谢通路,其中乙醛酸和二羧酸代谢(glyoxylate and dicarboxylate metabolism,GDMT)增强免疫治疗敏感性,而视黄醇代谢(retinol metabolism,RTM)则抑制免疫治疗效果。另外,通过癌细胞和CD8⁺T细胞共培养实验和小鼠荷瘤模型,团队对这两个通路对免疫治疗效果影响的相反作用进行了实验验证,为scResponse分析框架的实用性提供了概念验证。

图注:scResponse方法建立及文章主要研究内容

第一作者:

董琪,哈尔滨医科大学项目博士后,博士毕业于哈尔滨医科大学,主要利用高通量数据和生物信息学方法研究肿瘤微环境影响组分免疫治疗效果机制,目前作为第一作者发表多篇高水平学术论文。

黄海军,哈尔滨医科大学基础医学院2023级博士研究生,主要从事癌症表观遗传学及肿瘤免疫微环境相关研究。该研究获得国家自然科学基金、国家资助博士后研究人员计划、中国博士后基金和黑龙江省博士后基金的支持。

实验室更多信息可查看:https://haolabhmu.github.io

关键词:免疫治疗;单细胞;细胞状态;代谢

原文链接:https://doi.org/10.1002/advs.202524397

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